Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SH2B1Q9NRF2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms