Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-5Q9HDB9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms