Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COMMD5Q9GZQ3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms