Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms