Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCC1Q96CN9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCC1Q96CN9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCC1Q96CN9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCC1Q96CN9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCC1Q96CN9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCC1Q96CN9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCC1Q96CN9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCC1Q96CN9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCC1Q96CN9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCC1Q96CN9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms