Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY2Q8WXA3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms