Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms