Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms