Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC4Q8N9L1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms