Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms