Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms