Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC42EP5Q6NZY7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms