Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN1Q16799 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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