Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SRRM2-221ENST00000574866 638 ntTSL 319.75■□□□□ 0.752e-15■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 PRKCSH-219ENST00000593101 578 ntTSL 417.05■□□□□ 0.321e-6■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)13.46□□□□□ -0.252e-8■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.379e-7■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.179e-7■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.382e-16■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.763e-7■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.283e-6■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.349e-7■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 GSTP1-205ENST00000494593 1681 ntTSL 221.66■■□□□ 1.069e-7■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.129e-7■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 ASPSCR1-210ENST00000581608 2387 ntTSL 221.09■□□□□ 0.975e-7■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 ASPSCR1-205ENST00000578236 3277 ntTSL 213.49□□□□□ -0.255e-7■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 SRM-206ENST00000490101 461 ntTSL 219.75■□□□□ 0.753e-6■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.079e-12■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.439e-12■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.539e-12■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 RTN3-208ENST00000537981 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.729e-12■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 RTN3-206ENST00000377819 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.749e-12■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 RTN3-202ENST00000339997 4886 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.079e-12■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 UBAP2L-214ENST00000475373 838 ntTSL 210.46□□□□□ -0.737e-15■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 UBAP2L-215ENST00000484696 611 ntTSL 28.9□□□□□ -0.987e-15■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.154e-9■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.24e-9■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 TMEM214-205ENST00000434544 834 ntTSL 218.69■□□□□ 0.584e-6■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.154e-6■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.264e-6■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 TMEM214-210ENST00000469445 900 ntTSL 212.46□□□□□ -0.414e-6■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 LGALS3BP-219ENST00000592255 556 ntTSL 213.79□□□□□ -0.26e-10■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 MBOAT7-213ENST00000495279 1585 ntTSL 220.03■□□□□ 0.82e-6■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 COL27A1-207ENST00000494090 5329 ntTSL 1 (best)19.51■□□□□ 0.713e-6■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 CAPNS1-202ENST00000586851 616 ntTSL 37.95□□□□□ -1.145e-8■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.134e-7■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.684e-7■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 PFN1-202ENST00000572383 539 ntTSL 319.98■□□□□ 0.791e-6■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.273e-7■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 GNB1L-204ENST00000453108 702 ntTSL 322.74■■□□□ 1.233e-7■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 GNB1L-206ENST00000481086 854 ntTSL 321.01■□□□□ 0.953e-7■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 GNB1L-205ENST00000460402 1197 ntTSL 320.13■□□□□ 0.813e-7■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.773e-7■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 RTL10-205ENST00000484072 1385 ntTSL 214.98□□□□□ -0.013e-7■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.33e-7■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.383e-7■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.413e-7■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.733e-7■■□□□ 13.5
PCBP1Q15365 GSTP1-206ENST00000495996 221 ntTSL 210.25□□□□□ -0.772e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.72e-11■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.582e-11■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.532e-11■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.532e-11■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.522e-11■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-11■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 BSG-205ENST00000571735 2155 ntTSL 216.94■□□□□ 0.32e-11■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 UBAP2L-212ENST00000465855 684 ntTSL 311.39□□□□□ -0.594e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.994e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.024e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 UBAP2L-219ENST00000495676 867 ntTSL 35.95□□□□□ -1.464e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 WDR13-212ENST00000498631 859 ntTSL 222.83■■□□□ 1.251e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 WDR13-206ENST00000479279 2486 ntTSL 1 (best)19.4■□□□□ 0.71e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.631e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.541e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 WDR13-203ENST00000466962 684 ntTSL 317.67■□□□□ 0.421e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 WDR13-211ENST00000495575 547 ntTSL 213.92□□□□□ -0.181e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.861e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.771e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.621e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 CTSA-207ENST00000484855 2183 ntTSL 1 (best)17.89■□□□□ 0.451e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.311e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 CTSA-214ENST00000606788 3056 ntTSL 216.4■□□□□ 0.221e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 CTSA-210ENST00000606000 644 ntTSL 313.58□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.173e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.122e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.292e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.312e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 STXBP2-220ENST00000601061 706 ntTSL 322.49■■□□□ 1.194e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 STXBP2-208ENST00000595800 1974 ntTSL 222.11■■□□□ 1.134e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.254e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 STXBP2-214ENST00000599400 811 ntTSL 515.82■□□□□ 0.124e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 STXBP2-219ENST00000600702 770 ntTSL 214.11□□□□□ -0.154e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 MDC1-203ENST00000417033 916 ntTSL 28.78□□□□□ -13e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.535e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.935e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.595e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.921e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.861e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.811e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)16.74■□□□□ 0.271e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 516.17■□□□□ 0.181e-6■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.241e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 221.76■■□□□ 1.071e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.161e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.11e-7■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 14e-9■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.764e-9■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.491e-16■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 TNS1-216ENST00000480665 758 ntTSL 216.72■□□□□ 0.274e-8■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 RBM4-209ENST00000515838 943 ntTSL 216.72■□□□□ 0.271e-16■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 PSMF1-204ENST00000381898 642 ntTSL 315.84■□□□□ 0.134e-8■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -03e-13■■□□□ 13.4
PCBP1Q15365 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.053e-13■■□□□ 13.4
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