Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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