Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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