Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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