Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ST3GAL4Q11206 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ST3GAL4Q11206 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ST3GAL4Q11206 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ST3GAL4Q11206 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ST3GAL4Q11206 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ST3GAL4Q11206 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ST3GAL4Q11206 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ST3GAL4Q11206 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ST3GAL4Q11206 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ST3GAL4Q11206 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ST3GAL4Q11206 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ST3GAL4Q11206 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms