Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms