Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD1P98174 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD1P98174 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms