Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSN1S1P47710 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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