Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL35P42766 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL35P42766 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms