Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC19A1P41440 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC19A1P41440 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms