Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RCC1P18754 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RCC1P18754 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RCC1P18754 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RCC1P18754 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms