Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYL1P12980 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYL1P12980 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms