Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms