Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX3O75364 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX3O75364 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms