Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms