Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN1O60240 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN1O60240 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms