Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00587B1AMM8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms