Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACFD1Q9UGQ2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACFD1Q9UGQ2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACFD1Q9UGQ2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACFD1Q9UGQ2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACFD1Q9UGQ2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACFD1Q9UGQ2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACFD1Q9UGQ2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACFD1Q9UGQ2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACFD1Q9UGQ2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACFD1Q9UGQ2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACFD1Q9UGQ2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACFD1Q9UGQ2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACFD1Q9UGQ2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACFD1Q9UGQ2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms