Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRMQ9NS64 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms