Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM6SF1Q9BZW5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM6SF1Q9BZW5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM6SF1Q9BZW5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM6SF1Q9BZW5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM6SF1Q9BZW5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms