Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNPPD1Q9BV87 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms