Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ15

NABP2, SOSS complex subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP2Q9BQ15 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NABP2Q9BQ15 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms