Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms