Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms