Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms