Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA5Q6Q788 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms