Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms