Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GFI1BQ5VTD9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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GFI1BQ5VTD9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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GFI1BQ5VTD9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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