Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD4BQ5PRF9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms