Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3KQ59H18 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3KQ59H18 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3KQ59H18 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3KQ59H18 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3KQ59H18 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3KQ59H18 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3KQ59H18 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3KQ59H18 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3KQ59H18 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3KQ59H18 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNI3KQ59H18 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNI3KQ59H18 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNI3KQ59H18 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNI3KQ59H18 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3KQ59H18 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms