Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms