Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP10Q15642 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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