Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYCP1Q15431 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms