Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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GBX1Q14549 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX1Q14549 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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