Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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