Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms