Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FAM3BP58499 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FAM3BP58499 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FAM3BP58499 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM3BP58499 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM3BP58499 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM3BP58499 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM3BP58499 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM3BP58499 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM3BP58499 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FAM3BP58499 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FAM3BP58499 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FAM3BP58499 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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